水力發電（Hydroelectric power）是運用水的勢能轉換成電能，由於技術成熟、發電成本低，是目前人類社會應用最廣泛的可再生能源。不過，其中以大壩儲水的水力發電是否屬於可再生能源一直存在爭議，甚至有不少聲音提出要將其自潔淨能源行列中剔除。
隨著長時間研究出爐，以大壩儲水發電所造成的問題也慢慢顯現，包括水壩會產生大量的溫室氣體甲烷、對原有環境的破壞是永久不可逆轉的，但發電壽命卻有限。過去曾有國際團隊在《BioScience》期刊中發表研究報告推算，全球水壩、水庫每年產生高達 10 億噸溫室氣體，佔全球碳排放量 1.3 %，其中有 79 % 是溫室效應比二氧化碳還要強 36 倍的甲烷。此外，由於水壩工程浩大，興建水壩時所產生的溫室氣體是火力發電的數百倍。
現在，由香港大學生物科學學院名譽助理教授盧克‧吉布森（Luke Gibson）領導的國際團隊在《ScienceDirect》期刊上發表最新研究，他們比較了再生能源中風能、太陽能和水電對環境的潛在影響，依據危害程度做出排行，結論為水電「最不像綠能」，主要是由於維護蓄水池和大壩所建設的道路造成棲息地破碎損失，阻止動物遷徙並擾亂河流，而有一定深度的水壩形塑了壩底的缺氧環境，長期下來產生大量溫室氣體甲烷，特別是在熱帶地區。
研究合著者澳洲詹姆士庫克大學教授威廉‧勞倫斯（William Laurance）說，水電設施對熱帶雨林的生態多樣性而言根本是一場災難，它們不應該被列為「綠色能源」。
風力渦輪機和太陽能電池板也可能造成環境危害，風力渦輪機每年殺死 10 萬隻蝙蝠、增加環境溫度和噪音損害當地物種，風電場可能會影響鳥類的遷徙路線，但若與水電相比，傷害規模顯然要小得多。
目前，中國是全球再生能源第一大發展國，其水電、太陽能和風電發電量分別占全球的 28%、26% 和 35%，吉布森表示，我們必須密切關注這些綠色能源的開發，以確保新的設施不會傷害到野生動物或敏感棲息地。
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